Nosz kurza stopa, przecież napisałem, że Qubes OS umie uruchomić Windows. (Zakładając współczesne CPU.) Czyli twój problem sprowadza się do kupienia Windowsa.
Jedyne, czego nie umie, to emulować grafiki 3D - ponieważ trudno jest to zrobić sensownie i bezpiecznie. Do tego przydaje się druga karta grafiki i sprzęt umiejący IOMMU/VT-d - wtedy przekierowujesz ją i 3D ci działa.
Potrzeba ci dodatkowego monitora lub bajeru pozwalającego zczytać bufor ramki karty i go wyświetlić na innej - tzn. Optimus. Lub ewentualnie sprzętu do przełączenia wyjścia sprzętowo w całości.
Wsparcie dla Optimus/odpowiednika AMD jest jeszcze w powijakach niestety pod Linuxem w ogóle, nie mówiąc o Qubesie.
R.